Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms