Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdr42e1Q9D665 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms