Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5E3

4930449I24Rik, RIKEN cDNA 4930449I24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930449I24RikQ9D5E3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930449I24RikQ9D5E3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930449I24RikQ9D5E3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930449I24RikQ9D5E3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930449I24RikQ9D5E3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930449I24RikQ9D5E3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930449I24RikQ9D5E3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930449I24RikQ9D5E3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930449I24RikQ9D5E3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930449I24RikQ9D5E3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930449I24RikQ9D5E3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930449I24RikQ9D5E3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930449I24RikQ9D5E3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930449I24RikQ9D5E3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930449I24RikQ9D5E3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930449I24RikQ9D5E3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930449I24RikQ9D5E3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930449I24RikQ9D5E3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930449I24RikQ9D5E3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930449I24RikQ9D5E3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930449I24RikQ9D5E3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930449I24RikQ9D5E3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930449I24RikQ9D5E3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930449I24RikQ9D5E3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930449I24RikQ9D5E3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930449I24RikQ9D5E3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930449I24RikQ9D5E3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930449I24RikQ9D5E3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930449I24RikQ9D5E3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930449I24RikQ9D5E3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930449I24RikQ9D5E3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930449I24RikQ9D5E3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930449I24RikQ9D5E3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930449I24RikQ9D5E3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930449I24RikQ9D5E3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930449I24RikQ9D5E3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930449I24RikQ9D5E3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930449I24RikQ9D5E3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930449I24RikQ9D5E3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930449I24RikQ9D5E3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930449I24RikQ9D5E3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930449I24RikQ9D5E3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930449I24RikQ9D5E3 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930449I24RikQ9D5E3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930449I24RikQ9D5E3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930449I24RikQ9D5E3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930449I24RikQ9D5E3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
4930449I24RikQ9D5E3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
4930449I24RikQ9D5E3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4930449I24RikQ9D5E3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4930449I24RikQ9D5E3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4930449I24RikQ9D5E3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4930449I24RikQ9D5E3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4930449I24RikQ9D5E3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4930449I24RikQ9D5E3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4930449I24RikQ9D5E3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4930449I24RikQ9D5E3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4930449I24RikQ9D5E3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4930449I24RikQ9D5E3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms