Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms