Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D454 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D454 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D454 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D454 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D454 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D454 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D454 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D454 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D454 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D454 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D454 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D454 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D454 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D454 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D454 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D454 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D454 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D454 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D454 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D454 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D454 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D454 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D454 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D454 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D454 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D454 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D454 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D454 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D454 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D454 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D454 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D454 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D454 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D454 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D454 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D454 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D454 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D454 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D454 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D454 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D454 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D454 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D454 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D454 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D454 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D454 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D454 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D454 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D454 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D454 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D454 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D454 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D454 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D454 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D454 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D454 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D454 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D454 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D454 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D454 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D454 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D454 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D454 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D454 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D454 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D454 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D454 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D454 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D454 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D454 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D454 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D454 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9D454 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9D454 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9D454 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9D454 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9D454 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9D454 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9D454 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D454 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D454 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D454 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D454 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D454 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D454 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D454 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D454 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D454 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D454 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D454 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D454 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D454 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D454 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D454 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D454 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D454 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D454 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D454 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D454 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms