Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Stag1Q9D3E6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stag1Q9D3E6 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stag1Q9D3E6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stag1Q9D3E6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stag1Q9D3E6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms