Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Krt20Q9D312 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Krt20Q9D312 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Krt20Q9D312 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms