Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2J4

Vsig1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig1Q9D2J4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms