Protein–RNA interactions for Protein: Q9D287

Bcas2, Pre-mRNA-splicing factor SPF27, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas2Q9D287 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Bcas2Q9D287 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Bcas2Q9D287 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Bcas2Q9D287 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bcas2Q9D287 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bcas2Q9D287 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bcas2Q9D287 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bcas2Q9D287 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bcas2Q9D287 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bcas2Q9D287 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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