Protein–RNA interactions for Protein: Q9D275

Batf3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Batf3Q9D275 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Batf3Q9D275 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms