Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Spns3Q9D232 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Spns3Q9D232 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms