Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms