Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Zbed3Q9D0L1 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Zbed3Q9D0L1 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Zbed3Q9D0L1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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