Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I4

Stx17, Syntaxin-17, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx17Q9D0I4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Stx17Q9D0I4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx17Q9D0I4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms