Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtf2e1Q9D0D5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms