Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mms19Q9D071 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mms19Q9D071 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms