Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms