Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shmt2Q9CZN7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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