Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms