Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYA6

Zcchc8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc8Q9CYA6 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Zcchc8Q9CYA6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms