Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms