Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sgo1Q9CXH7 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms