Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX34

Sugt1, Protein SGT1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sugt1Q9CX34 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sugt1Q9CX34 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sugt1Q9CX34 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sugt1Q9CX34 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sugt1Q9CX34 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sugt1Q9CX34 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sugt1Q9CX34 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sugt1Q9CX34 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sugt1Q9CX34 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sugt1Q9CX34 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sugt1Q9CX34 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sugt1Q9CX34 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sugt1Q9CX34 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sugt1Q9CX34 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sugt1Q9CX34 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sugt1Q9CX34 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sugt1Q9CX34 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sugt1Q9CX34 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sugt1Q9CX34 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sugt1Q9CX34 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sugt1Q9CX34 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sugt1Q9CX34 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sugt1Q9CX34 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sugt1Q9CX34 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sugt1Q9CX34 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sugt1Q9CX34 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms