Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RpainQ9CWY9 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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RpainQ9CWY9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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RpainQ9CWY9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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RpainQ9CWY9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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RpainQ9CWY9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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RpainQ9CWY9 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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RpainQ9CWY9 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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RpainQ9CWY9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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RpainQ9CWY9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms