Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxxc1Q9CWW7 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms