Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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