Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWK8

Snx2, Sorting nexin-2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx2Q9CWK8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx2Q9CWK8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms