Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms