Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sycp2Q9CUU3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Sycp2Q9CUU3 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms