Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fcf1Q9CTH6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fcf1Q9CTH6 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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