Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Sft2d3Q9CSV6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Sft2d3Q9CSV6 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Sft2d3Q9CSV6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Sft2d3Q9CSV6 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Sft2d3Q9CSV6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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