Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pard3bQ9CSB4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
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