Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nudt21Q9CQF3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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