Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms