Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl39lQ9CQD0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms