Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpa3Q9CQ71 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms