Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Use1Q9CQ56 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Use1Q9CQ56 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Use1Q9CQ56 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Use1Q9CQ56 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Use1Q9CQ56 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Use1Q9CQ56 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Use1Q9CQ56 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Use1Q9CQ56 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Use1Q9CQ56 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Use1Q9CQ56 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Use1Q9CQ56 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Use1Q9CQ56 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Use1Q9CQ56 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Use1Q9CQ56 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Use1Q9CQ56 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Use1Q9CQ56 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Use1Q9CQ56 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Use1Q9CQ56 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Use1Q9CQ56 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Use1Q9CQ56 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Use1Q9CQ56 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Use1Q9CQ56 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Use1Q9CQ56 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Use1Q9CQ56 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Use1Q9CQ56 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Use1Q9CQ56 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Use1Q9CQ56 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Use1Q9CQ56 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Use1Q9CQ56 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Use1Q9CQ56 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Use1Q9CQ56 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Use1Q9CQ56 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Use1Q9CQ56 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Use1Q9CQ56 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Use1Q9CQ56 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Use1Q9CQ56 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Use1Q9CQ56 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Use1Q9CQ56 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Use1Q9CQ56 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Use1Q9CQ56 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Use1Q9CQ56 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Use1Q9CQ56 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Use1Q9CQ56 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Use1Q9CQ56 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Use1Q9CQ56 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Use1Q9CQ56 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Use1Q9CQ56 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Use1Q9CQ56 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Use1Q9CQ56 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Use1Q9CQ56 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Use1Q9CQ56 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Use1Q9CQ56 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Use1Q9CQ56 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Use1Q9CQ56 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Use1Q9CQ56 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Use1Q9CQ56 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Use1Q9CQ56 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Use1Q9CQ56 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Use1Q9CQ56 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms