Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms