Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Commd4Q9CQ02 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Commd4Q9CQ02 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Commd4Q9CQ02 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Commd4Q9CQ02 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Commd4Q9CQ02 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Commd4Q9CQ02 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Commd4Q9CQ02 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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