Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Atg3Q9CPX6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg3Q9CPX6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms