Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPU1

Ssxb1, MCG116417, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb1Q9CPU1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ssxb1Q9CPU1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ssxb1Q9CPU1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ssxb1Q9CPU1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssxb1Q9CPU1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ssxb1Q9CPU1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Ssxb1Q9CPU1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Ssxb1Q9CPU1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Ssxb1Q9CPU1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssxb1Q9CPU1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssxb1Q9CPU1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ssxb1Q9CPU1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssxb1Q9CPU1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssxb1Q9CPU1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssxb1Q9CPU1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssxb1Q9CPU1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ssxb1Q9CPU1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Ssxb1Q9CPU1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssxb1Q9CPU1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssxb1Q9CPU1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Ssxb1Q9CPU1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Ssxb1Q9CPU1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssxb1Q9CPU1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssxb1Q9CPU1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ssxb1Q9CPU1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssxb1Q9CPU1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ssxb1Q9CPU1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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