Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubxn6Q99PL6 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn6Q99PL6 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms