Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim3Q99PE5 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms