Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cep41Q99NF3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cep41Q99NF3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cep41Q99NF3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cep41Q99NF3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cep41Q99NF3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cep41Q99NF3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cep41Q99NF3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cep41Q99NF3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cep41Q99NF3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cep41Q99NF3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cep41Q99NF3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cep41Q99NF3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cep41Q99NF3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cep41Q99NF3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cep41Q99NF3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cep41Q99NF3 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cep41Q99NF3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cep41Q99NF3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cep41Q99NF3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cep41Q99NF3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cep41Q99NF3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cep41Q99NF3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cep41Q99NF3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cep41Q99NF3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cep41Q99NF3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cep41Q99NF3 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cep41Q99NF3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms