Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms