Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk5rap3Q99LM2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk5rap3Q99LM2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms