Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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Sh3bp5lQ99LH9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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Sh3bp5lQ99LH9 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Sh3bp5lQ99LH9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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Sh3bp5lQ99LH9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Sh3bp5lQ99LH9 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Sh3bp5lQ99LH9 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Sh3bp5lQ99LH9 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Sh3bp5lQ99LH9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp5lQ99LH9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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