Protein–RNA interactions for Protein: Q99LB7

Sardh, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SardhQ99LB7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SardhQ99LB7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SardhQ99LB7 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SardhQ99LB7 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SardhQ99LB7 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SardhQ99LB7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SardhQ99LB7 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SardhQ99LB7 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SardhQ99LB7 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SardhQ99LB7 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SardhQ99LB7 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SardhQ99LB7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SardhQ99LB7 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SardhQ99LB7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SardhQ99LB7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SardhQ99LB7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SardhQ99LB7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SardhQ99LB7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SardhQ99LB7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SardhQ99LB7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SardhQ99LB7 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SardhQ99LB7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SardhQ99LB7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SardhQ99LB7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SardhQ99LB7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SardhQ99LB7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SardhQ99LB7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms