Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
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