Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf34Q99KR6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms